MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli ETEC H10407 plasmid p948

Total Repeats: 1367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017724	ATA	2	6	1208	1213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387610387
2	NC_017724	CTG	2	6	1335	1340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610387
3	NC_017724	T	6	6	1361	1366	0 %	100 %	0 %	0 %	387610387
4	NC_017724	CTAC	2	8	1470	1477	25 %	25 %	0 %	50 %	387610387
5	NC_017724	GTCTTT	2	12	1511	1522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387610387
6	NC_017724	CTT	2	6	1677	1682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387610387
7	NC_017724	AGG	2	6	1690	1695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387610387
8	NC_017724	ATG	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610387
9	NC_017724	GCT	2	6	1826	1831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610387
10	NC_017724	TTG	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610387
11	NC_017724	TCTG	2	8	1898	1905	0 %	50 %	25 %	25 %	387610387
12	NC_017724	ATT	2	6	2033	2038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
13	NC_017724	TG	3	6	2139	2144	0 %	50 %	50 %	0 %	387610387
14	NC_017724	CTG	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610387
15	NC_017724	TCA	2	6	2226	2231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610387
16	NC_017724	GCT	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610387
17	NC_017724	A	6	6	2285	2290	100 %	0 %	0 %	0 %	387610387
18	NC_017724	CAA	2	6	2293	2298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387610387
19	NC_017724	TTG	2	6	2307	2312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610387
20	NC_017724	ATA	2	6	2538	2543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387610387
21	NC_017724	AAT	2	6	2586	2591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387610387
22	NC_017724	TAA	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387610387
23	NC_017724	TGC	2	6	2642	2647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610387
24	NC_017724	CTG	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610387
25	NC_017724	GGCT	2	8	2701	2708	0 %	25 %	50 %	25 %	387610387
26	NC_017724	AGT	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610387
27	NC_017724	AAT	2	6	2752	2757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387610387
28	NC_017724	ACT	2	6	2882	2887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610387
29	NC_017724	ACC	2	6	2963	2968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610387
30	NC_017724	CAG	2	6	3008	3013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610387
31	NC_017724	TAA	2	6	3027	3032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387610387
32	NC_017724	TGT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610387
33	NC_017724	AGA	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387610387
34	NC_017724	GCA	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610387
35	NC_017724	GA	3	6	3189	3194	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
36	NC_017724	TGC	2	6	3203	3208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610387
37	NC_017724	AG	3	6	3386	3391	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
38	NC_017724	TCT	2	6	3463	3468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387610387
39	NC_017724	TAT	2	6	3529	3534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
40	NC_017724	AGTA	2	8	3580	3587	50 %	25 %	25 %	0 %	387610387
41	NC_017724	ATA	2	6	3602	3607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387610387
42	NC_017724	C	6	6	3629	3634	0 %	0 %	0 %	100 %	387610387
43	NC_017724	TCATTT	2	12	3669	3680	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387610387
44	NC_017724	TTTGTT	2	12	3710	3721	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387610387
45	NC_017724	ATT	2	6	3776	3781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
46	NC_017724	GCTT	2	8	3900	3907	0 %	50 %	25 %	25 %	387610387
47	NC_017724	ATC	2	6	3917	3922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610387
48	NC_017724	TCC	2	6	3965	3970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387610387
49	NC_017724	ATT	2	6	3971	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
50	NC_017724	ATC	2	6	4028	4033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610387
51	NC_017724	ACC	2	6	4085	4090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610387
52	NC_017724	A	6	6	4136	4141	100 %	0 %	0 %	0 %	387610387
53	NC_017724	AGCC	2	8	4150	4157	25 %	0 %	25 %	50 %	387610387
54	NC_017724	TC	3	6	4186	4191	0 %	50 %	0 %	50 %	387610387
55	NC_017724	ATT	2	6	4193	4198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
56	NC_017724	T	7	7	4241	4247	0 %	100 %	0 %	0 %	387610387
57	NC_017724	CATG	2	8	4249	4256	25 %	25 %	25 %	25 %	387610387
58	NC_017724	CA	3	6	4260	4265	50 %	0 %	0 %	50 %	387610387
59	NC_017724	CT	3	6	4269	4274	0 %	50 %	0 %	50 %	387610387
60	NC_017724	TAT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
61	NC_017724	TGA	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610387
62	NC_017724	TTA	2	6	4410	4415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
63	NC_017724	TGA	2	6	4430	4435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610387
64	NC_017724	T	6	6	4457	4462	0 %	100 %	0 %	0 %	387610387
65	NC_017724	AG	3	6	4467	4472	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
66	NC_017724	TTTA	2	8	4505	4512	25 %	75 %	0 %	0 %	387610387
67	NC_017724	AT	3	6	4546	4551	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
68	NC_017724	ACC	2	6	4625	4630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610387
69	NC_017724	TA	3	6	4636	4641	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
70	NC_017724	TA	3	6	4670	4675	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
71	NC_017724	C	6	6	4715	4720	0 %	0 %	0 %	100 %	387610387
72	NC_017724	TAT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
73	NC_017724	GTT	2	6	4826	4831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387610387
74	NC_017724	CTA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610387
75	NC_017724	ATT	2	6	4850	4855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
76	NC_017724	ACA	2	6	4908	4913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387610387
77	NC_017724	TGG	2	6	4943	4948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610387
78	NC_017724	CTA	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610387
79	NC_017724	ATATTT	2	12	5037	5048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
80	NC_017724	AT	3	6	5107	5112	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
81	NC_017724	GCA	2	6	5127	5132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610387
82	NC_017724	ATT	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610387
83	NC_017724	A	6	6	5262	5267	100 %	0 %	0 %	0 %	387610387
84	NC_017724	AG	3	6	5277	5282	50 %	0 %	50 %	0 %	387610387
85	NC_017724	AT	3	6	5295	5300	50 %	50 %	0 %	0 %	387610387
86	NC_017724	ATC	2	6	6601	6606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610388
87	NC_017724	ATA	2	6	6622	6627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387610388
88	NC_017724	TTCTGC	2	12	6634	6645	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	387610388
89	NC_017724	TCG	2	6	6676	6681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610388
90	NC_017724	CCAC	2	8	6696	6703	25 %	0 %	0 %	75 %	387610388
91	NC_017724	TG	3	6	6860	6865	0 %	50 %	50 %	0 %	387610388
92	NC_017724	ATAC	2	8	6876	6883	50 %	25 %	0 %	25 %	387610388
93	NC_017724	ATG	2	6	7022	7027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610388
94	NC_017724	GAC	2	6	7039	7044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610388
95	NC_017724	GTAA	2	8	7063	7070	50 %	25 %	25 %	0 %	387610388
96	NC_017724	CCAC	2	8	7077	7084	25 %	0 %	0 %	75 %	387610388
97	NC_017724	GC	3	6	7213	7218	0 %	0 %	50 %	50 %	387610388
98	NC_017724	TTCC	2	8	7242	7249	0 %	50 %	0 %	50 %	387610388
99	NC_017724	AAC	2	6	7253	7258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387610388
100	NC_017724	TGA	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610388
101	NC_017724	TCTT	2	8	7319	7326	0 %	75 %	0 %	25 %	387610388
102	NC_017724	GAT	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610388
103	NC_017724	CAG	2	6	7465	7470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610388
104	NC_017724	GCG	2	6	7548	7553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610389
105	NC_017724	GGT	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610389
106	NC_017724	GCC	2	6	7708	7713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610389
107	NC_017724	TCAG	2	8	8893	8900	25 %	25 %	25 %	25 %	387610390
108	NC_017724	GCT	2	6	8909	8914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610390
109	NC_017724	AC	3	6	8955	8960	50 %	0 %	0 %	50 %	387610390
110	NC_017724	CG	3	6	9067	9072	0 %	0 %	50 %	50 %	387610390
111	NC_017724	GGAT	2	8	9130	9137	25 %	25 %	50 %	0 %	387610390
112	NC_017724	ACC	2	6	9171	9176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610390
113	NC_017724	TCA	2	6	9358	9363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610390
114	NC_017724	AGAA	2	8	9406	9413	75 %	0 %	25 %	0 %	387610390
115	NC_017724	CTG	2	6	9414	9419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610390
116	NC_017724	TGGC	2	8	9426	9433	0 %	25 %	50 %	25 %	387610390
117	NC_017724	CTGA	2	8	9468	9475	25 %	25 %	25 %	25 %	387610390
118	NC_017724	TG	3	6	9513	9518	0 %	50 %	50 %	0 %	387610390
119	NC_017724	CAG	2	6	9693	9698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610390
120	NC_017724	TTC	2	6	9786	9791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387610390
121	NC_017724	ACG	2	6	9825	9830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610390
122	NC_017724	GAC	2	6	9897	9902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610390
123	NC_017724	A	6	6	9909	9914	100 %	0 %	0 %	0 %	387610390
124	NC_017724	GTG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610390
125	NC_017724	TGGC	2	8	9921	9928	0 %	25 %	50 %	25 %	387610390
126	NC_017724	TAT	2	6	9995	10000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610390
127	NC_017724	TCC	2	6	10167	10172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387610391
128	NC_017724	GAATA	2	10	10201	10210	60 %	20 %	20 %	0 %	387610391
129	NC_017724	CAG	2	6	10281	10286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610391
130	NC_017724	TCA	2	6	10288	10293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610391
131	NC_017724	CAT	2	6	10335	10340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610391
132	NC_017724	TCA	2	6	10352	10357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387610391
133	NC_017724	GT	3	6	10364	10369	0 %	50 %	50 %	0 %	387610391
134	NC_017724	TAAA	2	8	10411	10418	75 %	25 %	0 %	0 %	387610391
135	NC_017724	CAGGC	2	10	10444	10453	20 %	0 %	40 %	40 %	387610391
136	NC_017724	CAG	2	6	10533	10538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610391
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143	NC_017724	CCG	2	6	10801	10806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610392
144	NC_017724	CTC	2	6	10814	10819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387610392
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249	NC_017724	TGA	2	6	17171	17176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610393
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254	NC_017724	G	6	6	17325	17330	0 %	0 %	100 %	0 %	387610393
255	NC_017724	GGT	2	6	17377	17382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610393
256	NC_017724	TCAC	2	8	17387	17394	25 %	25 %	0 %	50 %	387610393
257	NC_017724	CAC	3	9	17392	17400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610393
258	NC_017724	GCG	2	6	17410	17415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610393
259	NC_017724	TA	4	8	17433	17440	50 %	50 %	0 %	0 %	387610393
260	NC_017724	CG	3	6	17613	17618	0 %	0 %	50 %	50 %	387610394
261	NC_017724	CCG	2	6	17674	17679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610394
262	NC_017724	CTG	2	6	17745	17750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610394
263	NC_017724	CCGA	2	8	17776	17783	25 %	0 %	25 %	50 %	387610394
264	NC_017724	CCGG	2	8	17812	17819	0 %	0 %	50 %	50 %	387610394
265	NC_017724	GCCC	2	8	17909	17916	0 %	0 %	25 %	75 %	387610394
266	NC_017724	CTG	2	6	18000	18005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610394
267	NC_017724	TGC	2	6	18010	18015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610394
268	NC_017724	GAA	2	6	18033	18038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387610394
269	NC_017724	CGCT	2	8	18125	18132	0 %	25 %	25 %	50 %	387610394
270	NC_017724	CACCC	2	10	18138	18147	20 %	0 %	0 %	80 %	387610394
271	NC_017724	TGC	2	6	18161	18166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610394
272	NC_017724	GGT	2	6	18186	18191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387610394
273	NC_017724	T	6	6	18198	18203	0 %	100 %	0 %	0 %	387610394
274	NC_017724	AGGA	2	8	18253	18260	50 %	0 %	50 %	0 %	387610394
275	NC_017724	GACC	2	8	18263	18270	25 %	0 %	25 %	50 %	387610394
276	NC_017724	TGCCG	2	10	18291	18300	0 %	20 %	40 %	40 %	387610394
277	NC_017724	GTC	2	6	18336	18341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610394
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280	NC_017724	CCG	2	6	18601	18606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610394
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283	NC_017724	CCG	2	6	18638	18643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610394
284	NC_017724	CTT	2	6	18654	18659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387610394
285	NC_017724	CAG	3	9	18705	18713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610394
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288	NC_017724	GCA	2	6	18842	18847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387610394
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291	NC_017724	AG	3	6	18969	18974	50 %	0 %	50 %	0 %	387610394
292	NC_017724	AGG	2	6	19073	19078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387610394
293	NC_017724	CTC	2	6	19158	19163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387610394
294	NC_017724	GCAG	2	8	19229	19236	25 %	0 %	50 %	25 %	387610394
295	NC_017724	GGC	2	6	19265	19270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387610394
296	NC_017724	CG	3	6	19291	19296	0 %	0 %	50 %	50 %	387610394
297	NC_017724	AG	3	6	19299	19304	50 %	0 %	50 %	0 %	387610394
298	NC_017724	CAC	2	6	19341	19346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610394
299	NC_017724	CAC	2	6	19791	19796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387610395
300	NC_017724	AAG	2	6	19798	19803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387610395
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339	NC_017724	TTCAG	2	10	23082	23091	20 %	40 %	20 %	20 %	387610399
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369	NC_017724	AC	3	6	26829	26834	50 %	0 %	0 %	50 %	387610404
370	NC_017724	GTGG	2	8	26992	26999	0 %	25 %	75 %	0 %	387610404
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373	NC_017724	TTA	2	6	27067	27072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610404
374	NC_017724	GAT	2	6	27089	27094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610404
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376	NC_017724	TAT	2	6	27569	27574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387610405
377	NC_017724	TGC	2	6	27582	27587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610405
378	NC_017724	AT	3	6	27615	27620	50 %	50 %	0 %	0 %	387610405
379	NC_017724	GCATAT	2	12	27653	27664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387610405
380	NC_017724	CCG	2	6	27683	27688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610405
381	NC_017724	GTC	2	6	27739	27744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610405
382	NC_017724	GCC	2	6	27766	27771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387610405
383	NC_017724	ATG	2	6	28194	28199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610406
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386	NC_017724	TGC	2	6	28447	28452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387610406
387	NC_017724	AGA	2	6	28606	28611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387610406
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389	NC_017724	TGA	2	6	28747	28752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387610406
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